Tak jak w przypadku grzybicy stóp, tak również w przypadku paznokci ważna jest odpowiednia profilaktyka oraz świadomość zagrożenia. Pomocna w uniknięciu grzybicy paznokci jest stała pielęgnacja dłoni i stóp. Im bardziej są zadbane i zdrowe, tym ryzyko zakażenia grzybiczego mniejsze.
Warto pamiętać także o tym, że głównym źródłem zakażeń są baseny i sauny z drewnianymi podestami. Grzybicy paznokci sprzyja również używanie cudzych przyborów do zabiegów pedicure i manicure lub takich, które nie są dezynfekowane po każdym użyciu.
Rozwojowi grzybicy paznokcia sprzyjają też takie choroby jak: cukrzyca, niedokrwistość, otyłość, zaburzenia hormonalne czy zaburzenia krążenia.